Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700034E13RikQ9D2T6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700034E13RikQ9D2T6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700034E13RikQ9D2T6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms