Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnaaf1Q9D2H9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dnaaf1Q9D2H9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnaaf1Q9D2H9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnaaf1Q9D2H9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnaaf1Q9D2H9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms