Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930583I09RikQ9D2E3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930583I09RikQ9D2E3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930583I09RikQ9D2E3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms