Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chordc1Q9D1P4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chordc1Q9D1P4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chordc1Q9D1P4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chordc1Q9D1P4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chordc1Q9D1P4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chordc1Q9D1P4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chordc1Q9D1P4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms