Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan11Q9D1D1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan11Q9D1D1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tspan11Q9D1D1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan11Q9D1D1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan11Q9D1D1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms