Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B8

Dcdc2c, Doublecortin domain-containing protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2cQ9D1B8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dcdc2cQ9D1B8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dcdc2cQ9D1B8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dcdc2cQ9D1B8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dcdc2cQ9D1B8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dcdc2cQ9D1B8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dcdc2cQ9D1B8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dcdc2cQ9D1B8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dcdc2cQ9D1B8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dcdc2cQ9D1B8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dcdc2cQ9D1B8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms