Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hddc3Q9D114 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hddc3Q9D114 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hddc3Q9D114 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hddc3Q9D114 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hddc3Q9D114 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hddc3Q9D114 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms