Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lsm12Q9D0R8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lsm12Q9D0R8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lsm12Q9D0R8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lsm12Q9D0R8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lsm12Q9D0R8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lsm12Q9D0R8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms