Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc7Q9D0M0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Exosc7Q9D0M0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc7Q9D0M0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc7Q9D0M0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Exosc7Q9D0M0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Exosc7Q9D0M0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Exosc7Q9D0M0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exosc7Q9D0M0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exosc7Q9D0M0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Exosc7Q9D0M0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exosc7Q9D0M0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Exosc7Q9D0M0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms