Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D3

Mtpap, Poly(A) RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtpapQ9D0D3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MtpapQ9D0D3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MtpapQ9D0D3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MtpapQ9D0D3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MtpapQ9D0D3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MtpapQ9D0D3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MtpapQ9D0D3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MtpapQ9D0D3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MtpapQ9D0D3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MtpapQ9D0D3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MtpapQ9D0D3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MtpapQ9D0D3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MtpapQ9D0D3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MtpapQ9D0D3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MtpapQ9D0D3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms