Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acer3Q9D099 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acer3Q9D099 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acer3Q9D099 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acer3Q9D099 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acer3Q9D099 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms