Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mdm1Q9D067 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdm1Q9D067 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdm1Q9D067 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdm1Q9D067 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdm1Q9D067 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mdm1Q9D067 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Mdm1Q9D067 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mdm1Q9D067 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mdm1Q9D067 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm1Q9D067 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm1Q9D067 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms