Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc47Q9D024 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc47Q9D024 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc47Q9D024 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc47Q9D024 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc47Q9D024 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms