Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CrtapQ9CYD3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CrtapQ9CYD3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CrtapQ9CYD3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CrtapQ9CYD3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CrtapQ9CYD3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms