Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PmpcbQ9CXT8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PmpcbQ9CXT8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PmpcbQ9CXT8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PmpcbQ9CXT8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PmpcbQ9CXT8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms