Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr3kQ9CQZ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Polr3kQ9CQZ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr3kQ9CQZ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Polr3kQ9CQZ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Polr3kQ9CQZ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Polr3kQ9CQZ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr3kQ9CQZ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr3kQ9CQZ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3kQ9CQZ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3kQ9CQZ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr3kQ9CQZ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms