Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gkn2Q9CQS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gkn2Q9CQS6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gkn2Q9CQS6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gkn2Q9CQS6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gkn2Q9CQS6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gkn2Q9CQS6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gkn2Q9CQS6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gkn2Q9CQS6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms