Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW5

Ssr2, Translocon-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr2Q9CPW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssr2Q9CPW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssr2Q9CPW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr2Q9CPW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ssr2Q9CPW5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssr2Q9CPW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms