Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bhlhe41Q99PV5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bhlhe41Q99PV5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms