Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP7

Trim33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, mousemouse

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim33Q99PP7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim33Q99PP7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim33Q99PP7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim33Q99PP7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim33Q99PP7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim33Q99PP7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim33Q99PP7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim33Q99PP7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim33Q99PP7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim33Q99PP7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim33Q99PP7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim33Q99PP7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms