Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Trim26Q99PN3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trim26Q99PN3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim26Q99PN3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim26Q99PN3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Trim26Q99PN3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim26Q99PN3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim26Q99PN3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim26Q99PN3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim26Q99PN3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim26Q99PN3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim26Q99PN3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim26Q99PN3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim26Q99PN3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim26Q99PN3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim26Q99PN3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim26Q99PN3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms