Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chmp1b1Q99LU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp1b1Q99LU0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp1b1Q99LU0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp1b1Q99LU0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms