Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smtnl1Q99LM3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smtnl1Q99LM3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smtnl1Q99LM3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smtnl1Q99LM3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smtnl1Q99LM3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smtnl1Q99LM3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smtnl1Q99LM3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smtnl1Q99LM3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smtnl1Q99LM3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Smtnl1Q99LM3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smtnl1Q99LM3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms