Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lysmd3Q99LE3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lysmd3Q99LE3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lysmd3Q99LE3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lysmd3Q99LE3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lysmd3Q99LE3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lysmd3Q99LE3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms