Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gps1Q99LD4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gps1Q99LD4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gps1Q99LD4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gps1Q99LD4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gps1Q99LD4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gps1Q99LD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gps1Q99LD4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gps1Q99LD4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gps1Q99LD4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gps1Q99LD4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gps1Q99LD4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gps1Q99LD4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gps1Q99LD4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gps1Q99LD4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms