Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsl24d1Q99L28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsl24d1Q99L28 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsl24d1Q99L28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsl24d1Q99L28 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsl24d1Q99L28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsl24d1Q99L28 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsl24d1Q99L28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsl24d1Q99L28 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsl24d1Q99L28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsl24d1Q99L28 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsl24d1Q99L28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsl24d1Q99L28 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms