Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Higd1bQ99JY6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd1bQ99JY6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Higd1bQ99JY6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd1bQ99JY6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Higd1bQ99JY6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd1bQ99JY6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd1bQ99JY6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd1bQ99JY6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Higd1bQ99JY6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms