Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1dQ99246 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1dQ99246 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cacna1dQ99246 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1dQ99246 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1dQ99246 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms