Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf144aQ925F3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf144aQ925F3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf144aQ925F3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf144aQ925F3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf144aQ925F3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms