Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spdl1Q923A2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spdl1Q923A2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Spdl1Q923A2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spdl1Q923A2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spdl1Q923A2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spdl1Q923A2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spdl1Q923A2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spdl1Q923A2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spdl1Q923A2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Spdl1Q923A2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spdl1Q923A2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms