Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Clip1Q922J3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Clip1Q922J3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Clip1Q922J3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Clip1Q922J3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Clip1Q922J3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Clip1Q922J3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Clip1Q922J3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Clip1Q922J3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Clip1Q922J3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Clip1Q922J3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Clip1Q922J3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Clip1Q922J3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Clip1Q922J3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Clip1Q922J3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms