Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y16

Pcdha3, Protocadherin alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha3Q91Y16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha3Q91Y16 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha3Q91Y16 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha3Q91Y16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha3Q91Y16 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha3Q91Y16 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha3Q91Y16 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha3Q91Y16 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha3Q91Y16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha3Q91Y16 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha3Q91Y16 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha3Q91Y16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha3Q91Y16 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha3Q91Y16 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha3Q91Y16 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms