Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhga12Q91XY7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhga12Q91XY7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhga12Q91XY7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhga12Q91XY7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhga12Q91XY7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhga12Q91XY7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhga12Q91XY7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcdhga12Q91XY7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcdhga12Q91XY7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhga12Q91XY7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms