Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lims2Q91XD2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lims2Q91XD2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lims2Q91XD2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lims2Q91XD2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lims2Q91XD2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lims2Q91XD2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms