Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usb1Q91W78 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usb1Q91W78 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usb1Q91W78 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usb1Q91W78 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usb1Q91W78 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms