Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hps3Q91VB4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps3Q91VB4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Hps3Q91VB4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hps3Q91VB4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hps3Q91VB4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hps3Q91VB4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Hps3Q91VB4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms