Protein–RNA interactions for Protein: Q91V81

Rbm42, RNA-binding protein 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm42Q91V81 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm42Q91V81 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbm42Q91V81 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm42Q91V81 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm42Q91V81 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm42Q91V81 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm42Q91V81 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm42Q91V81 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm42Q91V81 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm42Q91V81 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm42Q91V81 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm42Q91V81 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms