Protein–RNA interactions for Protein: Q91V48

Pcdhb21, MCG1033322, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb21Q91V48 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb21Q91V48 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhb21Q91V48 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb21Q91V48 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb21Q91V48 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb21Q91V48 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhb21Q91V48 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb21Q91V48 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdhb21Q91V48 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb21Q91V48 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhb21Q91V48 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb21Q91V48 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb21Q91V48 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb21Q91V48 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdhb21Q91V48 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb21Q91V48 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb21Q91V48 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms