Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ppargc1bQ8VHJ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ppargc1bQ8VHJ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms