Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt79Q8VED5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt79Q8VED5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt79Q8VED5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt79Q8VED5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt79Q8VED5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt79Q8VED5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt79Q8VED5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt79Q8VED5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt79Q8VED5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt79Q8VED5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms