Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8VDP2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8VDP2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8VDP2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8VDP2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8VDP2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q8VDP2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8VDP2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8VDP2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8VDP2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms