Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Washc1Q8VDD8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Washc1Q8VDD8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Washc1Q8VDD8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Washc1Q8VDD8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Washc1Q8VDD8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Washc1Q8VDD8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Washc1Q8VDD8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms