Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpap2Q8VC34 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpap2Q8VC34 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpap2Q8VC34 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpap2Q8VC34 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpap2Q8VC34 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpap2Q8VC34 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpap2Q8VC34 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpap2Q8VC34 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rpap2Q8VC34 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpap2Q8VC34 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpap2Q8VC34 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpap2Q8VC34 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpap2Q8VC34 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpap2Q8VC34 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms