Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx19Q8R1Q0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx19Q8R1Q0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx19Q8R1Q0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx19Q8R1Q0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx19Q8R1Q0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx19Q8R1Q0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms