Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B4

Eif3c, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3cQ8R1B4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eif3cQ8R1B4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eif3cQ8R1B4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eif3cQ8R1B4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3cQ8R1B4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Eif3cQ8R1B4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Eif3cQ8R1B4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Eif3cQ8R1B4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Eif3cQ8R1B4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3cQ8R1B4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms