Protein–RNA interactions for Protein: Q8R191

Syngr3, Synaptogyrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr3Q8R191 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syngr3Q8R191 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syngr3Q8R191 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syngr3Q8R191 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngr3Q8R191 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr3Q8R191 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr3Q8R191 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr3Q8R191 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms