Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q7

Cerk, Ceramide kinase, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerkQ8K4Q7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CerkQ8K4Q7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CerkQ8K4Q7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CerkQ8K4Q7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CerkQ8K4Q7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CerkQ8K4Q7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CerkQ8K4Q7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CerkQ8K4Q7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CerkQ8K4Q7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CerkQ8K4Q7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms