Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Hecw1Q8K4P8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
Hecw1Q8K4P8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Hecw1Q8K4P8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Hecw1Q8K4P8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Hecw1Q8K4P8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Hecw1Q8K4P8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Hecw1Q8K4P8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Hecw1Q8K4P8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Hecw1Q8K4P8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Hecw1Q8K4P8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Hecw1Q8K4P8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Hecw1Q8K4P8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Hecw1Q8K4P8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Hecw1Q8K4P8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Hecw1Q8K4P8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Hecw1Q8K4P8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Hecw1Q8K4P8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms