Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnot6Q8K3P5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot6Q8K3P5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnot6Q8K3P5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnot6Q8K3P5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnot6Q8K3P5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms