Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp45Q8K387 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp45Q8K387 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp45Q8K387 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp45Q8K387 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp45Q8K387 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp45Q8K387 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms